Parallel zum ÖPNV mit Bus und Bahn wird es an den Wochenenden und an Feiertagen auch eine Schiffsverbindung geben. Die Schiffe pendeln vier Mal am Tag und bieten eine luftige Alternative zu den öffentlichen Verkehrsmitteln. Der Linienverkehr im ÖPNV-Modus ist für die Reederei eine gute Möglichkeit, zumindest im kleinen Rahmen den Betrieb aufzunehmen, da nach wie vor keine touristischen Rund- und Ausflugsfahrten angeboten werden dürfen. An Bord gelten die allgemein üblichen Abstands- und Hygieneregeln sowie Maskenpflicht. Gastronomischer Service wie sonst üblich, wird an Bord nicht angeboten.

Ebenfalls am 08. Mai 2021 starten die Schiffe des Potsdamer Wassertaxi in den Linienverkehr. An den Wochenenden und Feiertagen wird zunächst ein verkürztes Liniennetz auf der Nordroute befahren. An sieben Stationen zwischen dem Hafen Potsdam (Pier A/Hotelseite) und Sacrow können Fahrgäste dann ein- und aussteigen und auch ihre Fahrräder mitnehmen.

Bis zum offiziellen Saisonstart wird das südliche Liniennetz Richtung Forsthaus Templin nicht angefahren, da die anliegenden Hotels aktuell noch nicht wieder in Betrieb sind. Die Wassertaxis gehen aber wieder mit dem kompletten Fahrplan auf Tour, sobald der uneingeschränkte Schiffsverkehr möglich ist.